Финал европейского отборочного турнира к Кубку мира против испанцев (3:5) стал для экс-арсенальца Егора Шайкова 100‑м в составе сборной России.

В составе национальной команды он участвовал в 4 чемпионатах мира (2007–09, 2011), стал чемпионом мира (2011), 2‑кратным чемпионом Европы (2010, 2012), 2‑кратным (2009, 2011) победителем и 3‑кратным (2007, 2008, 2010) бронзовым призёром Евролиги. Выиграв чемпионат мира в 2011 году, Шайков оказался в числе отечественных игроков, кому впервые удалось завоевать титул чемпиона планеты в одной из официальных разновидностей футбола.

В 100 матчах за сборную России Шайков забил 96 мячей.